1、宫腔疾病
子宫是胚胎孕育的温床，如果女性患有子宫肌瘤、宫腔粘连、子宫内膜炎、子宫内膜息肉、子宫内膜薄等疾病时，都会降低胚胎着床率。
2、输卵管积水
输卵管积水中含有各种炎性混合物，可干扰胚胎与子宫内膜接触，降低子宫内膜容受性。
3、免疫因素
母体免疫机制异常可导致子宫内膜对胚胎产生排斥现象，阻碍胚胎着床。
4、凝血异常
如果子宫内膜供血不足，胎盘小血管内血栓形成，也会导致胚胎无法着床于子宫内膜。
除了胚胎因素和母体因素外，患者的心理因素也是影响胚胎着床的关键。
接受试管婴儿的患者，往往给了自己过大的心理和精神压力，而对助孕结局的未知又使压力加大，若长时间的处于焦虑、紧张、忧郁等不良情绪中就会引发内分泌失调，并激活人体的应激系统，造成子宫肌肉收缩紊乱，进而影响胚胎种植。